Sebelum keluaran NCAA Football 06, satu-satunya muzik yang ditampilkan dalam permainan adalah lagu pertarungan kebanyakan kolej FBS dan FCS yang dipaparkan dalam permainan. Lagu ini akan diputar secara rawak, tetapi "pasukan kegemaran" yang dipilih oleh pengguna akan sentiasa memainkan lagu pertarungan mereka terlebih dahulu setiap kali permainan dimulakan.

NCAA Football 06 adalah penyertaan pertama dan satu-satunya dalam siri ini yang menyertakan muzik berlesen untuk memastikan keseragaman dengan keluaran EA Sports yang lain pada masa itu, seperti Madden NFL dan siri NHL.

NCAA Football 07 kembali kepada format lagu perjuangan sahaja.

NCAA Football 08 menambahkan lagu tema sinematik pada menu utama, dengan lagu pertarungan dimainkan semasa Mod Dinasti.

NCAA Football 09 memperkenankan ciri bunyi stadium tersuai baru yang membolehkan pengguna mengedit bunyi yang terdengar di stadium tertentu semasa acara dalam permainan, seperti touchdown, gol padang, atau tamat masa. Peminat pasukan kini dapat mencipta pengalaman yang lebih autentik di setiap stadium dengan menggunakan lagu yang dilindungi hak cipta yang tidak dibenarkan oleh EA untuk dimasukkan ke dalam permainan.

NCAA Football 10 memainkan "Tick Tick Boom" oleh The Hives dalam pengenalan sahaja.

NCAA Football 11 menggunakan muzik yang digunakan dalam liputan ESPN College Football .